Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SP140Q13342 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SP140Q13342 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SP140Q13342 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SP140Q13342 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP140Q13342 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP140Q13342 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP140Q13342 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SP140Q13342 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP140Q13342 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP140Q13342 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP140Q13342 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP140Q13342 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP140Q13342 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SP140Q13342 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP140Q13342 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SP140Q13342 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP140Q13342 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP140Q13342 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP140Q13342 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SP140Q13342 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SP140Q13342 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SP140Q13342 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SP140Q13342 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SP140Q13342 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SP140Q13342 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP140Q13342 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP140Q13342 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP140Q13342 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP140Q13342 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SP140Q13342 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SP140Q13342 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SP140Q13342 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SP140Q13342 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SP140Q13342 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SP140Q13342 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SP140Q13342 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SP140Q13342 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SP140Q13342 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP140Q13342 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP140Q13342 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP140Q13342 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP140Q13342 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP140Q13342 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SP140Q13342 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SP140Q13342 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SP140Q13342 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SP140Q13342 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP140Q13342 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP140Q13342 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP140Q13342 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP140Q13342 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP140Q13342 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SP140Q13342 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP140Q13342 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP140Q13342 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP140Q13342 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP140Q13342 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SP140Q13342 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP140Q13342 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP140Q13342 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP140Q13342 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP140Q13342 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP140Q13342 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SP140Q13342 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SP140Q13342 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SP140Q13342 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP140Q13342 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SP140Q13342 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP140Q13342 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP140Q13342 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP140Q13342 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP140Q13342 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP140Q13342 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP140Q13342 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP140Q13342 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP140Q13342 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP140Q13342 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP140Q13342 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP140Q13342 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP140Q13342 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP140Q13342 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP140Q13342 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP140Q13342 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP140Q13342 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP140Q13342 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP140Q13342 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP140Q13342 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP140Q13342 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP140Q13342 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP140Q13342 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP140Q13342 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP140Q13342 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP140Q13342 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP140Q13342 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP140Q13342 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP140Q13342 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP140Q13342 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP140Q13342 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP140Q13342 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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