Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX3Q13185 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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