Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAF1BQ13112 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1BQ13112 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1BQ13112 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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