Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC16Q13042 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC16Q13042 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC16Q13042 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC16Q13042 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC16Q13042 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC16Q13042 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC16Q13042 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC16Q13042 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC16Q13042 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC16Q13042 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC16Q13042 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC16Q13042 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC16Q13042 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC16Q13042 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC16Q13042 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
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