Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXC1Q12948 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXC1Q12948 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXC1Q12948 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms