Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms