Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPTFQ12830 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BPTFQ12830 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPTFQ12830 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
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