Protein–RNA interactions for Protein: Q11201

ST3GAL1, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL1Q11201 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ST3GAL1Q11201 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ST3GAL1Q11201 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ST3GAL1Q11201 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ST3GAL1Q11201 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ST3GAL1Q11201 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ST3GAL1Q11201 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ST3GAL1Q11201 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ST3GAL1Q11201 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ST3GAL1Q11201 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ST3GAL1Q11201 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ST3GAL1Q11201 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ST3GAL1Q11201 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ST3GAL1Q11201 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ST3GAL1Q11201 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ST3GAL1Q11201 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ST3GAL1Q11201 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ST3GAL1Q11201 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ST3GAL1Q11201 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
ST3GAL1Q11201 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ST3GAL1Q11201 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ST3GAL1Q11201 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ST3GAL1Q11201 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ST3GAL1Q11201 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ST3GAL1Q11201 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ST3GAL1Q11201 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ST3GAL1Q11201 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ST3GAL1Q11201 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ST3GAL1Q11201 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ST3GAL1Q11201 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ST3GAL1Q11201 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ST3GAL1Q11201 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ST3GAL1Q11201 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ST3GAL1Q11201 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ST3GAL1Q11201 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ST3GAL1Q11201 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ST3GAL1Q11201 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ST3GAL1Q11201 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ST3GAL1Q11201 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ST3GAL1Q11201 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ST3GAL1Q11201 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ST3GAL1Q11201 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ST3GAL1Q11201 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms