Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGL1

LAMTOR4, Ragulator complex protein LAMTOR4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4Q0VGL1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMTOR4Q0VGL1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMTOR4Q0VGL1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMTOR4Q0VGL1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMTOR4Q0VGL1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMTOR4Q0VGL1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMTOR4Q0VGL1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMTOR4Q0VGL1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMTOR4Q0VGL1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMTOR4Q0VGL1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMTOR4Q0VGL1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMTOR4Q0VGL1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMTOR4Q0VGL1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMTOR4Q0VGL1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMTOR4Q0VGL1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMTOR4Q0VGL1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMTOR4Q0VGL1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMTOR4Q0VGL1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMTOR4Q0VGL1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMTOR4Q0VGL1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMTOR4Q0VGL1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMTOR4Q0VGL1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms