Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EP300Q09472 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EP300Q09472 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EP300Q09472 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
EP300Q09472 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EP300Q09472 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EP300Q09472 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EP300Q09472 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EP300Q09472 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EP300Q09472 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EP300Q09472 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP300Q09472 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP300Q09472 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP300Q09472 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP300Q09472 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP300Q09472 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP300Q09472 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP300Q09472 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP300Q09472 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP300Q09472 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP300Q09472 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EP300Q09472 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP300Q09472 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP300Q09472 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EP300Q09472 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EP300Q09472 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EP300Q09472 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EP300Q09472 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EP300Q09472 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EP300Q09472 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EP300Q09472 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EP300Q09472 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EP300Q09472 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EP300Q09472 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EP300Q09472 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EP300Q09472 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EP300Q09472 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EP300Q09472 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EP300Q09472 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EP300Q09472 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EP300Q09472 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EP300Q09472 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EP300Q09472 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EP300Q09472 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EP300Q09472 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EP300Q09472 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EP300Q09472 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EP300Q09472 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EP300Q09472 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP300Q09472 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP300Q09472 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP300Q09472 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EP300Q09472 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EP300Q09472 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EP300Q09472 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EP300Q09472 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EP300Q09472 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EP300Q09472 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EP300Q09472 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EP300Q09472 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EP300Q09472 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EP300Q09472 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EP300Q09472 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EP300Q09472 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EP300Q09472 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EP300Q09472 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EP300Q09472 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EP300Q09472 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EP300Q09472 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EP300Q09472 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EP300Q09472 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EP300Q09472 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP300Q09472 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EP300Q09472 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP300Q09472 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP300Q09472 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EP300Q09472 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EP300Q09472 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EP300Q09472 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EP300Q09472 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EP300Q09472 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EP300Q09472 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP300Q09472 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP300Q09472 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP300Q09472 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EP300Q09472 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EP300Q09472 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP300Q09472 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EP300Q09472 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP300Q09472 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EP300Q09472 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP300Q09472 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP300Q09472 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EP300Q09472 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP300Q09472 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP300Q09472 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP300Q09472 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP300Q09472 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EP300Q09472 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EP300Q09472 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms