Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CACNB2Q08289 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNB2Q08289 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNB2Q08289 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNB2Q08289 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNB2Q08289 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CACNB2Q08289 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNB2Q08289 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CACNB2Q08289 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNB2Q08289 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNB2Q08289 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms