Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBQ06643 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBQ06643 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBQ06643 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBQ06643 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBQ06643 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBQ06643 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBQ06643 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBQ06643 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBQ06643 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBQ06643 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBQ06643 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBQ06643 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBQ06643 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBQ06643 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBQ06643 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBQ06643 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBQ06643 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBQ06643 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBQ06643 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBQ06643 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBQ06643 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBQ06643 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBQ06643 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBQ06643 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBQ06643 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBQ06643 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBQ06643 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBQ06643 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBQ06643 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBQ06643 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBQ06643 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBQ06643 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBQ06643 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBQ06643 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBQ06643 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBQ06643 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBQ06643 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBQ06643 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBQ06643 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBQ06643 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBQ06643 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBQ06643 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBQ06643 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBQ06643 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBQ06643 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBQ06643 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBQ06643 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBQ06643 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBQ06643 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBQ06643 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBQ06643 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBQ06643 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBQ06643 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBQ06643 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBQ06643 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBQ06643 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBQ06643 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBQ06643 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBQ06643 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBQ06643 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBQ06643 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBQ06643 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBQ06643 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBQ06643 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBQ06643 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBQ06643 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBQ06643 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBQ06643 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBQ06643 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBQ06643 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBQ06643 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBQ06643 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBQ06643 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBQ06643 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBQ06643 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBQ06643 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBQ06643 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBQ06643 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBQ06643 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBQ06643 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBQ06643 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBQ06643 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBQ06643 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBQ06643 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBQ06643 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBQ06643 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBQ06643 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LTBQ06643 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBQ06643 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBQ06643 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBQ06643 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBQ06643 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBQ06643 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBQ06643 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBQ06643 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBQ06643 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBQ06643 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBQ06643 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBQ06643 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms