Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITIH3Q06033 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITIH3Q06033 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITIH3Q06033 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITIH3Q06033 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITIH3Q06033 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITIH3Q06033 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITIH3Q06033 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITIH3Q06033 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITIH3Q06033 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITIH3Q06033 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITIH3Q06033 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITIH3Q06033 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITIH3Q06033 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITIH3Q06033 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ITIH3Q06033 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITIH3Q06033 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITIH3Q06033 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITIH3Q06033 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITIH3Q06033 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITIH3Q06033 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITIH3Q06033 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITIH3Q06033 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITIH3Q06033 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITIH3Q06033 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITIH3Q06033 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITIH3Q06033 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITIH3Q06033 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITIH3Q06033 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITIH3Q06033 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITIH3Q06033 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ITIH3Q06033 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ITIH3Q06033 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITIH3Q06033 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITIH3Q06033 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITIH3Q06033 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms