Protein–RNA interactions for Protein: Q05925

EN1, Homeobox protein engrailed-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EN1Q05925 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
EN1Q05925 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
EN1Q05925 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
EN1Q05925 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
EN1Q05925 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
EN1Q05925 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
EN1Q05925 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
EN1Q05925 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
EN1Q05925 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
EN1Q05925 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
EN1Q05925 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
EN1Q05925 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
EN1Q05925 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
EN1Q05925 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
EN1Q05925 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
EN1Q05925 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
EN1Q05925 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
EN1Q05925 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
EN1Q05925 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
EN1Q05925 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
EN1Q05925 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.71
EN1Q05925 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
EN1Q05925 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
EN1Q05925 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
EN1Q05925 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
EN1Q05925 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32■■■□□ 2.71
EN1Q05925 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
EN1Q05925 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
EN1Q05925 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
EN1Q05925 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
EN1Q05925 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
EN1Q05925 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
EN1Q05925 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
EN1Q05925 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
EN1Q05925 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
EN1Q05925 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
EN1Q05925 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
EN1Q05925 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
EN1Q05925 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
EN1Q05925 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
EN1Q05925 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
EN1Q05925 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
EN1Q05925 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
EN1Q05925 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
EN1Q05925 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
EN1Q05925 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
EN1Q05925 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
EN1Q05925 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
EN1Q05925 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
EN1Q05925 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
EN1Q05925 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
EN1Q05925 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
EN1Q05925 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
EN1Q05925 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
EN1Q05925 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
EN1Q05925 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
EN1Q05925 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
EN1Q05925 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
EN1Q05925 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
EN1Q05925 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
EN1Q05925 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
EN1Q05925 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
EN1Q05925 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
EN1Q05925 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
EN1Q05925 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
EN1Q05925 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
EN1Q05925 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
EN1Q05925 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
EN1Q05925 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
EN1Q05925 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
EN1Q05925 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
EN1Q05925 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
EN1Q05925 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
EN1Q05925 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
EN1Q05925 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
EN1Q05925 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
EN1Q05925 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
EN1Q05925 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
EN1Q05925 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
EN1Q05925 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
EN1Q05925 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
EN1Q05925 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
EN1Q05925 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
EN1Q05925 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
EN1Q05925 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
EN1Q05925 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
EN1Q05925 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
EN1Q05925 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
EN1Q05925 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
EN1Q05925 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
EN1Q05925 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
EN1Q05925 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
EN1Q05925 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
EN1Q05925 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
EN1Q05925 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
EN1Q05925 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC31.84■■■□□ 2.69
EN1Q05925 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
EN1Q05925 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
EN1Q05925 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
EN1Q05925 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms