Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF90Q03938 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF90Q03938 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF90Q03938 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms