Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFHR1Q03591 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHR1Q03591 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFHR1Q03591 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms