Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1DQ01668 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1DQ01668 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms