Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SCN7AQ01118 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SCN7AQ01118 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SCN7AQ01118 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms