Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PKD1P98161 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKD1P98161 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKD1P98161 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKD1P98161 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKD1P98161 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKD1P98161 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKD1P98161 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKD1P98161 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKD1P98161 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKD1P98161 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKD1P98161 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKD1P98161 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKD1P98161 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKD1P98161 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKD1P98161 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKD1P98161 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PKD1P98161 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PKD1P98161 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKD1P98161 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKD1P98161 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKD1P98161 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKD1P98161 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PKD1P98161 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKD1P98161 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKD1P98161 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKD1P98161 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKD1P98161 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKD1P98161 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKD1P98161 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKD1P98161 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKD1P98161 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKD1P98161 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKD1P98161 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKD1P98161 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKD1P98161 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKD1P98161 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKD1P98161 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKD1P98161 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKD1P98161 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKD1P98161 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PKD1P98161 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKD1P98161 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKD1P98161 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKD1P98161 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKD1P98161 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKD1P98161 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PKD1P98161 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKD1P98161 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKD1P98161 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKD1P98161 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKD1P98161 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKD1P98161 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKD1P98161 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PKD1P98161 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKD1P98161 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKD1P98161 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKD1P98161 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKD1P98161 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKD1P98161 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKD1P98161 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKD1P98161 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKD1P98161 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PKD1P98161 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKD1P98161 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKD1P98161 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKD1P98161 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKD1P98161 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKD1P98161 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKD1P98161 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKD1P98161 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKD1P98161 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PKD1P98161 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PKD1P98161 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PKD1P98161 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKD1P98161 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKD1P98161 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKD1P98161 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKD1P98161 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD1P98161 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD1P98161 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD1P98161 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD1P98161 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD1P98161 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD1P98161 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD1P98161 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD1P98161 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD1P98161 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD1P98161 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD1P98161 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD1P98161 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD1P98161 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD1P98161 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD1P98161 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD1P98161 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD1P98161 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD1P98161 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD1P98161 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD1P98161 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD1P98161 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms