Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMAD3P84022 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMAD3P84022 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMAD3P84022 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMAD3P84022 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMAD3P84022 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMAD3P84022 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMAD3P84022 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMAD3P84022 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMAD3P84022 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMAD3P84022 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMAD3P84022 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMAD3P84022 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMAD3P84022 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMAD3P84022 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMAD3P84022 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMAD3P84022 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SMAD3P84022 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMAD3P84022 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMAD3P84022 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMAD3P84022 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMAD3P84022 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMAD3P84022 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMAD3P84022 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms