Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG7P83436 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG7P83436 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG7P83436 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG7P83436 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG7P83436 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG7P83436 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG7P83436 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
COG7P83436 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
COG7P83436 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG7P83436 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG7P83436 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG7P83436 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG7P83436 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG7P83436 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG7P83436 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG7P83436 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG7P83436 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG7P83436 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG7P83436 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG7P83436 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG7P83436 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG7P83436 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG7P83436 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG7P83436 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG7P83436 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG7P83436 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG7P83436 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG7P83436 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG7P83436 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG7P83436 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG7P83436 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COG7P83436 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COG7P83436 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG7P83436 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG7P83436 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG7P83436 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG7P83436 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG7P83436 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG7P83436 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG7P83436 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG7P83436 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COG7P83436 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG7P83436 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG7P83436 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG7P83436 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG7P83436 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG7P83436 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COG7P83436 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG7P83436 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG7P83436 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG7P83436 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG7P83436 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG7P83436 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
COG7P83436 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
COG7P83436 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG7P83436 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG7P83436 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG7P83436 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG7P83436 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG7P83436 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG7P83436 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG7P83436 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG7P83436 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG7P83436 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG7P83436 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG7P83436 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COG7P83436 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG7P83436 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG7P83436 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG7P83436 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG7P83436 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG7P83436 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG7P83436 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG7P83436 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
COG7P83436 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG7P83436 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG7P83436 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG7P83436 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG7P83436 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG7P83436 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG7P83436 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG7P83436 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG7P83436 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG7P83436 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG7P83436 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG7P83436 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG7P83436 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG7P83436 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG7P83436 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG7P83436 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG7P83436 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG7P83436 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG7P83436 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG7P83436 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG7P83436 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG7P83436 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COG7P83436 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG7P83436 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG7P83436 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms