Protein–RNA interactions for Protein: P78324

SIRPA, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPAP78324 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRPAP78324 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRPAP78324 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms