Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBA4AP68366 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA4AP68366 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms