Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKP1P63208 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKP1P63208 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SKP1P63208 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKP1P63208 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKP1P63208 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKP1P63208 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKP1P63208 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKP1P63208 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKP1P63208 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SKP1P63208 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKP1P63208 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKP1P63208 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKP1P63208 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKP1P63208 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKP1P63208 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKP1P63208 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKP1P63208 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SKP1P63208 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SKP1P63208 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKP1P63208 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKP1P63208 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SKP1P63208 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKP1P63208 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKP1P63208 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKP1P63208 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKP1P63208 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKP1P63208 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKP1P63208 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKP1P63208 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SKP1P63208 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKP1P63208 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKP1P63208 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKP1P63208 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKP1P63208 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKP1P63208 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKP1P63208 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKP1P63208 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKP1P63208 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKP1P63208 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKP1P63208 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKP1P63208 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKP1P63208 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKP1P63208 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKP1P63208 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKP1P63208 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SKP1P63208 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKP1P63208 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKP1P63208 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKP1P63208 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKP1P63208 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SKP1P63208 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKP1P63208 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKP1P63208 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKP1P63208 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKP1P63208 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKP1P63208 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKP1P63208 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKP1P63208 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKP1P63208 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKP1P63208 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKP1P63208 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKP1P63208 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKP1P63208 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKP1P63208 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SKP1P63208 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SKP1P63208 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKP1P63208 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKP1P63208 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SKP1P63208 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKP1P63208 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKP1P63208 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKP1P63208 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKP1P63208 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKP1P63208 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKP1P63208 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKP1P63208 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKP1P63208 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKP1P63208 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKP1P63208 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKP1P63208 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKP1P63208 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKP1P63208 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKP1P63208 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SKP1P63208 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKP1P63208 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKP1P63208 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKP1P63208 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKP1P63208 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKP1P63208 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKP1P63208 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKP1P63208 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKP1P63208 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKP1P63208 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKP1P63208 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKP1P63208 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKP1P63208 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKP1P63208 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKP1P63208 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKP1P63208 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms