Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRA2BP62995 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRA2BP62995 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRA2BP62995 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRA2BP62995 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRA2BP62995 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRA2BP62995 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRA2BP62995 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRA2BP62995 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRA2BP62995 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRA2BP62995 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRA2BP62995 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRA2BP62995 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms