Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS29P62273 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS29P62273 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS29P62273 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS29P62273 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS29P62273 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPS29P62273 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPS29P62273 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPS29P62273 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPS29P62273 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPS29P62273 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPS29P62273 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS29P62273 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS29P62273 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS29P62273 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS29P62273 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS29P62273 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS29P62273 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS29P62273 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS29P62273 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS29P62273 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS29P62273 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPS29P62273 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPS29P62273 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPS29P62273 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPS29P62273 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPS29P62273 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPS29P62273 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPS29P62273 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPS29P62273 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPS29P62273 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RPS29P62273 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPS29P62273 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPS29P62273 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPS29P62273 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPS29P62273 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPS29P62273 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPS29P62273 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPS29P62273 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS29P62273 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS29P62273 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS29P62273 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS29P62273 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS29P62273 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS29P62273 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS29P62273 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS29P62273 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS29P62273 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS29P62273 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS29P62273 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS29P62273 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RPS29P62273 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS29P62273 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS29P62273 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS29P62273 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS29P62273 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS29P62273 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS29P62273 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS29P62273 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS29P62273 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS29P62273 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS29P62273 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS29P62273 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS29P62273 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS29P62273 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPS29P62273 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RPS29P62273 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPS29P62273 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPS29P62273 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPS29P62273 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPS29P62273 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPS29P62273 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPS29P62273 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPS29P62273 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RPS29P62273 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPS29P62273 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPS29P62273 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RPS29P62273 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPS29P62273 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPS29P62273 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPS29P62273 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPS29P62273 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPS29P62273 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPS29P62273 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPS29P62273 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPS29P62273 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RPS29P62273 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPS29P62273 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPS29P62273 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPS29P62273 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RPS29P62273 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPS29P62273 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPS29P62273 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPS29P62273 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPS29P62273 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPS29P62273 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPS29P62273 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPS29P62273 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPS29P62273 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPS29P62273 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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