Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOAP61586 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOAP61586 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOAP61586 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOAP61586 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOAP61586 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOAP61586 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOAP61586 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOAP61586 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOAP61586 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOAP61586 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOAP61586 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOAP61586 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOAP61586 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOAP61586 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOAP61586 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOAP61586 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOAP61586 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOAP61586 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOAP61586 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOAP61586 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOAP61586 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOAP61586 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOAP61586 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOAP61586 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOAP61586 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOAP61586 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOAP61586 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOAP61586 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOAP61586 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOAP61586 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOAP61586 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOAP61586 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOAP61586 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOAP61586 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOAP61586 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOAP61586 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOAP61586 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOAP61586 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOAP61586 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOAP61586 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOAP61586 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOAP61586 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOAP61586 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOAP61586 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOAP61586 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOAP61586 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOAP61586 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOAP61586 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOAP61586 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOAP61586 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOAP61586 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOAP61586 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOAP61586 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOAP61586 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOAP61586 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOAP61586 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOAP61586 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOAP61586 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOAP61586 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOAP61586 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOAP61586 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOAP61586 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOAP61586 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOAP61586 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOAP61586 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOAP61586 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOAP61586 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOAP61586 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOAP61586 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOAP61586 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOAP61586 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOAP61586 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOAP61586 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOAP61586 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOAP61586 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOAP61586 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOAP61586 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOAP61586 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHOAP61586 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOAP61586 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOAP61586 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOAP61586 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOAP61586 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOAP61586 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOAP61586 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOAP61586 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOAP61586 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOAP61586 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOAP61586 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOAP61586 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOAP61586 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOAP61586 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOAP61586 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOAP61586 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOAP61586 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOAP61586 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOAP61586 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOAP61586 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOAP61586 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms