Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK11-1P61568 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ERVK11-1P61568 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK11-1P61568 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.1 ms