Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NLRP6P59044 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NLRP6P59044 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NLRP6P59044 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NLRP6P59044 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NLRP6P59044 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NLRP6P59044 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NLRP6P59044 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NLRP6P59044 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms