Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX16P57768 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX16P57768 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX16P57768 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX16P57768 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX16P57768 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX16P57768 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX16P57768 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNX16P57768 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SNX16P57768 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX16P57768 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX16P57768 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX16P57768 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX16P57768 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX16P57768 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX16P57768 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX16P57768 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX16P57768 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX16P57768 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX16P57768 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX16P57768 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX16P57768 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX16P57768 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX16P57768 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX16P57768 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX16P57768 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX16P57768 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX16P57768 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX16P57768 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX16P57768 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX16P57768 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX16P57768 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX16P57768 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX16P57768 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX16P57768 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX16P57768 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX16P57768 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX16P57768 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX16P57768 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX16P57768 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX16P57768 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX16P57768 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX16P57768 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX16P57768 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX16P57768 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX16P57768 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX16P57768 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX16P57768 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX16P57768 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX16P57768 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX16P57768 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX16P57768 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX16P57768 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX16P57768 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX16P57768 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX16P57768 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX16P57768 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX16P57768 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX16P57768 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX16P57768 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX16P57768 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX16P57768 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX16P57768 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX16P57768 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX16P57768 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX16P57768 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX16P57768 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX16P57768 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX16P57768 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX16P57768 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX16P57768 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX16P57768 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX16P57768 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX16P57768 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX16P57768 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX16P57768 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX16P57768 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX16P57768 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX16P57768 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX16P57768 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX16P57768 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX16P57768 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX16P57768 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX16P57768 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX16P57768 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX16P57768 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX16P57768 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX16P57768 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX16P57768 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX16P57768 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX16P57768 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX16P57768 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX16P57768 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX16P57768 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX16P57768 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX16P57768 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX16P57768 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX16P57768 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX16P57768 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX16P57768 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms