Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN15P56746 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms