Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FCGRTP55899 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FCGRTP55899 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FCGRTP55899 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FCGRTP55899 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FCGRTP55899 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FCGRTP55899 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FCGRTP55899 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FCGRTP55899 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FCGRTP55899 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FCGRTP55899 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FCGRTP55899 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FCGRTP55899 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FCGRTP55899 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FCGRTP55899 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FCGRTP55899 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FCGRTP55899 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FCGRTP55899 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FCGRTP55899 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FCGRTP55899 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FCGRTP55899 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FCGRTP55899 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FCGRTP55899 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FCGRTP55899 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms