Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SUMO3P55854 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUMO3P55854 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 669.6 ms