Protein–RNA interactions for Protein: P55316

FOXG1, Forkhead box protein G1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXG1P55316 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXG1P55316 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXG1P55316 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXG1P55316 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXG1P55316 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXG1P55316 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXG1P55316 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms