Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH8P55286 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH8P55286 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH8P55286 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH8P55286 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH8P55286 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH8P55286 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH8P55286 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH8P55286 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH8P55286 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH8P55286 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH8P55286 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH8P55286 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH8P55286 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH8P55286 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH8P55286 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH8P55286 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH8P55286 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH8P55286 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH8P55286 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH8P55286 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH8P55286 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH8P55286 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH8P55286 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH8P55286 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH8P55286 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH8P55286 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH8P55286 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH8P55286 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH8P55286 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH8P55286 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH8P55286 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH8P55286 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH8P55286 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH8P55286 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH8P55286 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH8P55286 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH8P55286 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH8P55286 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH8P55286 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH8P55286 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH8P55286 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH8P55286 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH8P55286 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH8P55286 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH8P55286 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH8P55286 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH8P55286 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH8P55286 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH8P55286 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH8P55286 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH8P55286 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH8P55286 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH8P55286 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH8P55286 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH8P55286 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH8P55286 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH8P55286 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH8P55286 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH8P55286 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH8P55286 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH8P55286 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH8P55286 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH8P55286 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH8P55286 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDH8P55286 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDH8P55286 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDH8P55286 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDH8P55286 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDH8P55286 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CDH8P55286 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDH8P55286 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH8P55286 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH8P55286 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH8P55286 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH8P55286 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH8P55286 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH8P55286 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH8P55286 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH8P55286 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH8P55286 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH8P55286 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH8P55286 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH8P55286 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH8P55286 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH8P55286 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH8P55286 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH8P55286 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH8P55286 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH8P55286 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH8P55286 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDH8P55286 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH8P55286 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH8P55286 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH8P55286 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH8P55286 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH8P55286 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH8P55286 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH8P55286 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH8P55286 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms