Protein–RNA interactions for Protein: P55283

CDH4, Cadherin-4, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH4P55283 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH4P55283 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH4P55283 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH4P55283 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH4P55283 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH4P55283 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH4P55283 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH4P55283 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH4P55283 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH4P55283 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH4P55283 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH4P55283 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH4P55283 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH4P55283 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH4P55283 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH4P55283 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH4P55283 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH4P55283 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH4P55283 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH4P55283 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH4P55283 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH4P55283 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH4P55283 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH4P55283 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH4P55283 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH4P55283 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH4P55283 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH4P55283 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH4P55283 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH4P55283 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH4P55283 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDH4P55283 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH4P55283 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH4P55283 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH4P55283 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH4P55283 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH4P55283 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH4P55283 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH4P55283 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH4P55283 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH4P55283 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH4P55283 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH4P55283 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH4P55283 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH4P55283 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH4P55283 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH4P55283 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH4P55283 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH4P55283 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH4P55283 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH4P55283 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH4P55283 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH4P55283 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH4P55283 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH4P55283 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH4P55283 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH4P55283 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH4P55283 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH4P55283 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH4P55283 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH4P55283 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH4P55283 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH4P55283 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH4P55283 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH4P55283 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH4P55283 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH4P55283 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH4P55283 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH4P55283 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH4P55283 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH4P55283 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH4P55283 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH4P55283 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH4P55283 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH4P55283 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH4P55283 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH4P55283 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH4P55283 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH4P55283 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH4P55283 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH4P55283 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH4P55283 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH4P55283 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH4P55283 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH4P55283 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH4P55283 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH4P55283 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH4P55283 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH4P55283 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH4P55283 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH4P55283 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH4P55283 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH4P55283 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH4P55283 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH4P55283 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH4P55283 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH4P55283 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH4P55283 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH4P55283 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH4P55283 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms