Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATXN1P54253 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATXN1P54253 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATXN1P54253 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATXN1P54253 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATXN1P54253 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATXN1P54253 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATXN1P54253 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATXN1P54253 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATXN1P54253 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATXN1P54253 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATXN1P54253 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATXN1P54253 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATXN1P54253 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATXN1P54253 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATXN1P54253 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATXN1P54253 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATXN1P54253 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATXN1P54253 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATXN1P54253 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATXN1P54253 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATXN1P54253 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATXN1P54253 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATXN1P54253 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATXN1P54253 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms