Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLR2KP53803 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 346.8 ms