Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NDST1P52848 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDST1P52848 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDST1P52848 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDST1P52848 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDST1P52848 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDST1P52848 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDST1P52848 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDST1P52848 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NDST1P52848 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NDST1P52848 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NDST1P52848 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NDST1P52848 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NDST1P52848 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NDST1P52848 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NDST1P52848 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NDST1P52848 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NDST1P52848 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NDST1P52848 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDST1P52848 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDST1P52848 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDST1P52848 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDST1P52848 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDST1P52848 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDST1P52848 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NDST1P52848 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDST1P52848 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDST1P52848 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NDST1P52848 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NDST1P52848 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NDST1P52848 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NDST1P52848 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NDST1P52848 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NDST1P52848 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NDST1P52848 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NDST1P52848 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NDST1P52848 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NDST1P52848 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NDST1P52848 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NDST1P52848 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NDST1P52848 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NDST1P52848 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NDST1P52848 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NDST1P52848 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NDST1P52848 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NDST1P52848 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NDST1P52848 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NDST1P52848 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NDST1P52848 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NDST1P52848 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NDST1P52848 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NDST1P52848 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NDST1P52848 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NDST1P52848 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NDST1P52848 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NDST1P52848 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDST1P52848 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDST1P52848 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDST1P52848 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDST1P52848 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDST1P52848 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDST1P52848 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDST1P52848 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDST1P52848 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDST1P52848 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDST1P52848 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDST1P52848 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDST1P52848 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDST1P52848 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDST1P52848 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDST1P52848 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDST1P52848 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDST1P52848 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDST1P52848 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDST1P52848 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NDST1P52848 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NDST1P52848 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NDST1P52848 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NDST1P52848 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NDST1P52848 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NDST1P52848 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NDST1P52848 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NDST1P52848 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NDST1P52848 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NDST1P52848 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDST1P52848 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NDST1P52848 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDST1P52848 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDST1P52848 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NDST1P52848 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NDST1P52848 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NDST1P52848 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NDST1P52848 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NDST1P52848 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NDST1P52848 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NDST1P52848 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NDST1P52848 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NDST1P52848 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NDST1P52848 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NDST1P52848 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms