Protein–RNA interactions for Protein: P52815

MRPL12, 39S ribosomal protein L12, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL12P52815 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPL12P52815 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MRPL12P52815 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MRPL12P52815 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MRPL12P52815 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MRPL12P52815 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPL12P52815 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPL12P52815 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPL12P52815 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPL12P52815 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPL12P52815 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms