Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB28P51157 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB28P51157 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB28P51157 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB28P51157 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB28P51157 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB28P51157 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB28P51157 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB28P51157 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB28P51157 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB28P51157 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB28P51157 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB28P51157 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB28P51157 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB28P51157 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB28P51157 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB28P51157 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB28P51157 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB28P51157 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB28P51157 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB28P51157 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB28P51157 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB28P51157 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB28P51157 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB28P51157 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB28P51157 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB28P51157 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB28P51157 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB28P51157 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB28P51157 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB28P51157 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB28P51157 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB28P51157 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB28P51157 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB28P51157 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB28P51157 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB28P51157 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB28P51157 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB28P51157 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB28P51157 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB28P51157 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB28P51157 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB28P51157 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB28P51157 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB28P51157 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB28P51157 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB28P51157 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB28P51157 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB28P51157 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB28P51157 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB28P51157 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB28P51157 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB28P51157 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB28P51157 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB28P51157 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB28P51157 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB28P51157 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB28P51157 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB28P51157 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB28P51157 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB28P51157 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB28P51157 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB28P51157 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB28P51157 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB28P51157 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB28P51157 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB28P51157 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB28P51157 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB28P51157 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB28P51157 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB28P51157 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB28P51157 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB28P51157 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB28P51157 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB28P51157 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB28P51157 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB28P51157 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB28P51157 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB28P51157 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB28P51157 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB28P51157 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB28P51157 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB28P51157 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB28P51157 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB28P51157 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB28P51157 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB28P51157 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB28P51157 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB28P51157 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB28P51157 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB28P51157 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB28P51157 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB28P51157 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB28P51157 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB28P51157 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB28P51157 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB28P51157 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB28P51157 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB28P51157 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB28P51157 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms