Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A2P50993 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A2P50993 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1A2P50993 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms