Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CDK7P50613 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK7P50613 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK7P50613 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK7P50613 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK7P50613 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK7P50613 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK7P50613 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK7P50613 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK7P50613 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK7P50613 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK7P50613 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK7P50613 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK7P50613 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK7P50613 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK7P50613 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK7P50613 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK7P50613 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK7P50613 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK7P50613 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK7P50613 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK7P50613 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK7P50613 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK7P50613 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK7P50613 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK7P50613 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK7P50613 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK7P50613 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK7P50613 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK7P50613 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK7P50613 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK7P50613 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK7P50613 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK7P50613 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK7P50613 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK7P50613 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK7P50613 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK7P50613 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK7P50613 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK7P50613 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK7P50613 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK7P50613 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK7P50613 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK7P50613 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK7P50613 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK7P50613 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK7P50613 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK7P50613 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK7P50613 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK7P50613 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK7P50613 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK7P50613 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK7P50613 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK7P50613 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK7P50613 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK7P50613 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK7P50613 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK7P50613 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK7P50613 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK7P50613 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK7P50613 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK7P50613 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK7P50613 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK7P50613 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK7P50613 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK7P50613 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK7P50613 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK7P50613 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK7P50613 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK7P50613 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK7P50613 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK7P50613 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK7P50613 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK7P50613 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK7P50613 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK7P50613 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK7P50613 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK7P50613 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK7P50613 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK7P50613 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK7P50613 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK7P50613 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK7P50613 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK7P50613 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK7P50613 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK7P50613 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK7P50613 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK7P50613 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK7P50613 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK7P50613 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK7P50613 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK7P50613 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK7P50613 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK7P50613 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK7P50613 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK7P50613 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK7P50613 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK7P50613 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK7P50613 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK7P50613 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms