Protein–RNA interactions for Protein: P50553

ASCL1, Achaete-scute homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL1P50553 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASCL1P50553 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASCL1P50553 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms