Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GATMP50440 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GATMP50440 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GATMP50440 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GATMP50440 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GATMP50440 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GATMP50440 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GATMP50440 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GATMP50440 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GATMP50440 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GATMP50440 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GATMP50440 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GATMP50440 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GATMP50440 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GATMP50440 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GATMP50440 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GATMP50440 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GATMP50440 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GATMP50440 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GATMP50440 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GATMP50440 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GATMP50440 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GATMP50440 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GATMP50440 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GATMP50440 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GATMP50440 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GATMP50440 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GATMP50440 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GATMP50440 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GATMP50440 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GATMP50440 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GATMP50440 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GATMP50440 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GATMP50440 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GATMP50440 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GATMP50440 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GATMP50440 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GATMP50440 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GATMP50440 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GATMP50440 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GATMP50440 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GATMP50440 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GATMP50440 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GATMP50440 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GATMP50440 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GATMP50440 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GATMP50440 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GATMP50440 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GATMP50440 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GATMP50440 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GATMP50440 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GATMP50440 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GATMP50440 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GATMP50440 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GATMP50440 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GATMP50440 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GATMP50440 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GATMP50440 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GATMP50440 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GATMP50440 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GATMP50440 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GATMP50440 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GATMP50440 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GATMP50440 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GATMP50440 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GATMP50440 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GATMP50440 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GATMP50440 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GATMP50440 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GATMP50440 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GATMP50440 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GATMP50440 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GATMP50440 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GATMP50440 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GATMP50440 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GATMP50440 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GATMP50440 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GATMP50440 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GATMP50440 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GATMP50440 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GATMP50440 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GATMP50440 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GATMP50440 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GATMP50440 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GATMP50440 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GATMP50440 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GATMP50440 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GATMP50440 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GATMP50440 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GATMP50440 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GATMP50440 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GATMP50440 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GATMP50440 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GATMP50440 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GATMP50440 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GATMP50440 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GATMP50440 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GATMP50440 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GATMP50440 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GATMP50440 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms