Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP4P49662 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP4P49662 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP4P49662 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP4P49662 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP4P49662 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP4P49662 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP4P49662 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP4P49662 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP4P49662 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP4P49662 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP4P49662 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP4P49662 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP4P49662 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP4P49662 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP4P49662 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP4P49662 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP4P49662 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP4P49662 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP4P49662 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP4P49662 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP4P49662 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP4P49662 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASP4P49662 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASP4P49662 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASP4P49662 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASP4P49662 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASP4P49662 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASP4P49662 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CASP4P49662 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP4P49662 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP4P49662 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP4P49662 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP4P49662 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP4P49662 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP4P49662 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP4P49662 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP4P49662 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP4P49662 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP4P49662 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP4P49662 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP4P49662 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP4P49662 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP4P49662 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP4P49662 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP4P49662 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP4P49662 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP4P49662 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP4P49662 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASP4P49662 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASP4P49662 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASP4P49662 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASP4P49662 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP4P49662 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP4P49662 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP4P49662 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP4P49662 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP4P49662 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASP4P49662 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASP4P49662 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASP4P49662 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASP4P49662 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASP4P49662 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASP4P49662 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASP4P49662 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CASP4P49662 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CASP4P49662 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASP4P49662 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASP4P49662 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP4P49662 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP4P49662 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP4P49662 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP4P49662 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP4P49662 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP4P49662 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP4P49662 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP4P49662 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP4P49662 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASP4P49662 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASP4P49662 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASP4P49662 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASP4P49662 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP4P49662 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP4P49662 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP4P49662 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP4P49662 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP4P49662 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP4P49662 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP4P49662 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP4P49662 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP4P49662 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP4P49662 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP4P49662 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP4P49662 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP4P49662 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP4P49662 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP4P49662 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP4P49662 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP4P49662 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP4P49662 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms