Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNTAP49354 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNTAP49354 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FNTAP49354 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FNTAP49354 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FNTAP49354 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FNTAP49354 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FNTAP49354 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNTAP49354 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNTAP49354 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNTAP49354 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNTAP49354 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNTAP49354 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNTAP49354 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNTAP49354 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNTAP49354 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNTAP49354 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNTAP49354 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNTAP49354 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNTAP49354 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNTAP49354 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNTAP49354 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNTAP49354 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNTAP49354 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNTAP49354 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNTAP49354 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNTAP49354 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNTAP49354 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNTAP49354 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNTAP49354 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNTAP49354 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNTAP49354 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNTAP49354 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNTAP49354 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNTAP49354 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNTAP49354 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNTAP49354 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNTAP49354 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNTAP49354 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNTAP49354 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FNTAP49354 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNTAP49354 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNTAP49354 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNTAP49354 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNTAP49354 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNTAP49354 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNTAP49354 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNTAP49354 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNTAP49354 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNTAP49354 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNTAP49354 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNTAP49354 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNTAP49354 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNTAP49354 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNTAP49354 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNTAP49354 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNTAP49354 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNTAP49354 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNTAP49354 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNTAP49354 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FNTAP49354 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FNTAP49354 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNTAP49354 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNTAP49354 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNTAP49354 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FNTAP49354 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNTAP49354 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNTAP49354 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNTAP49354 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNTAP49354 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNTAP49354 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNTAP49354 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNTAP49354 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNTAP49354 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNTAP49354 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FNTAP49354 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNTAP49354 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNTAP49354 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNTAP49354 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNTAP49354 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNTAP49354 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNTAP49354 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNTAP49354 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNTAP49354 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNTAP49354 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNTAP49354 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FNTAP49354 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNTAP49354 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNTAP49354 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FNTAP49354 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNTAP49354 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNTAP49354 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNTAP49354 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FNTAP49354 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNTAP49354 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNTAP49354 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNTAP49354 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNTAP49354 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FNTAP49354 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNTAP49354 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms