Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
NRIP1P48552 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRIP1P48552 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRIP1P48552 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms