Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSSP48449 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSSP48449 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LSSP48449 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSSP48449 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSSP48449 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSSP48449 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSSP48449 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LSSP48449 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSSP48449 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LSSP48449 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LSSP48449 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LSSP48449 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSSP48449 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LSSP48449 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LSSP48449 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSSP48449 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSSP48449 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSSP48449 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LSSP48449 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LSSP48449 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSSP48449 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSSP48449 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LSSP48449 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSSP48449 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSSP48449 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSSP48449 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSSP48449 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSSP48449 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSSP48449 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSSP48449 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSSP48449 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSSP48449 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSSP48449 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSSP48449 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSSP48449 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSSP48449 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSSP48449 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSSP48449 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSSP48449 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LSSP48449 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LSSP48449 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LSSP48449 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LSSP48449 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSSP48449 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSSP48449 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSSP48449 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSSP48449 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSSP48449 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSSP48449 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSSP48449 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSSP48449 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSSP48449 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSSP48449 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSSP48449 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSSP48449 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSSP48449 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSSP48449 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LSSP48449 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LSSP48449 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSSP48449 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSSP48449 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSSP48449 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSSP48449 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSSP48449 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSSP48449 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSSP48449 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSSP48449 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSSP48449 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSSP48449 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSSP48449 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSSP48449 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSSP48449 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSSP48449 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSSP48449 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSSP48449 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSSP48449 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSSP48449 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSSP48449 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LSSP48449 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LSSP48449 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSSP48449 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSSP48449 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LSSP48449 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSSP48449 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSSP48449 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSSP48449 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSSP48449 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSSP48449 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSSP48449 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSSP48449 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSSP48449 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSSP48449 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSSP48449 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSSP48449 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LSSP48449 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LSSP48449 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LSSP48449 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSSP48449 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSSP48449 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms