Protein–RNA interactions for Protein: P48436

SOX9, Transcription factor SOX-9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9P48436 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX9P48436 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX9P48436 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX9P48436 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX9P48436 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX9P48436 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX9P48436 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX9P48436 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX9P48436 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX9P48436 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX9P48436 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX9P48436 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX9P48436 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX9P48436 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX9P48436 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX9P48436 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX9P48436 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX9P48436 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX9P48436 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX9P48436 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX9P48436 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX9P48436 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX9P48436 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX9P48436 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SOX9P48436 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX9P48436 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX9P48436 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX9P48436 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX9P48436 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX9P48436 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX9P48436 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX9P48436 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX9P48436 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX9P48436 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX9P48436 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX9P48436 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX9P48436 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX9P48436 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX9P48436 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX9P48436 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX9P48436 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX9P48436 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX9P48436 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX9P48436 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX9P48436 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX9P48436 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX9P48436 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX9P48436 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX9P48436 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX9P48436 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX9P48436 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX9P48436 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX9P48436 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX9P48436 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX9P48436 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX9P48436 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX9P48436 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX9P48436 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX9P48436 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX9P48436 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX9P48436 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX9P48436 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX9P48436 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX9P48436 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX9P48436 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX9P48436 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX9P48436 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SOX9P48436 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SOX9P48436 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SOX9P48436 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SOX9P48436 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SOX9P48436 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX9P48436 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SOX9P48436 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX9P48436 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX9P48436 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX9P48436 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX9P48436 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX9P48436 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX9P48436 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX9P48436 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX9P48436 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX9P48436 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX9P48436 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX9P48436 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX9P48436 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX9P48436 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX9P48436 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX9P48436 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX9P48436 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX9P48436 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX9P48436 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX9P48436 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX9P48436 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX9P48436 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX9P48436 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX9P48436 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX9P48436 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX9P48436 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX9P48436 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms